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Results DNA analysis as input for Fit2Breed

Recently, a large number of (sponsored) DNA samples were distributed among Kooikerhondjes which are used in breeding or that may be used in breeding in the future. This data is used to further fill the database of the Fit2Breed app with DNA data. The Fit2Breed software can be used by breeders to get a scientifically based breeding advice for his/her dog.

Since DNA data is already available from many breeding animals, the VHNK has made a preselection of breeding animals to participate in the DNA research. Earlier this year, the received samples have been gathered by the University of Utrecht and were sent towards Wisdom Panel for DNA analysis. Collecting the of the second batch DNA samples unfortunately took longer than expected, which resulted in a delay of the test results. The first results have been received by the owners towards the end of March.

How to interpret the received results?

Every owner has received an email from Wisdom Panel with the notification that the DNA test report is available through his/her account. This account has been created by each owner for the registration of the DNA samples. The DNA test report of the dog shows screening results for several genetic conditions.

It should be noted that – with the exception of VWD – these are not breed-specific conditions. The genetic diversity of the dog is considered to be the most important data gathered. This data is of importance for Fit2Breed in order to determine the genetic variation within the breed.

What to do with the results?

After receiving the results no further actions are expected from the owner. The gathered DNA will automatically be imported into the Fit2Breed app and hereby results in the necessary input to determine to genetic variation within the breed. This input will contribute to breeding healthy and social Kooikerhondjes in a responsible manner in the short term.

Ergebnisse DNA-Analyse als Input für Fit2Breed

In der letzten Zeit wurden viele (gesponserte) DNA-Swabs unter Zuchttieren verteilt. Weiterentwicklung der neuen App Fit2Breed genutzt werden. In der App werden mit DNA-Daten kombiniert. Die App wurde entwickelt, um dem Züchter ein Werkzeug bei eines geeigneten Partners für seine Hündin zur Verfügung zu stellen.

Da bereits von vielen Zuchttieren DANN Proben verfügbar sind, hat die VHNK anhand der Listen eine Auswahl von Zuchttieren getroffen. Die entnommenen Proben wurden Anfang von der Universität Utrecht gesammelt, danach wurden die DNA-Proben zusammen zur Durchführung der DNA-Analyse zu Wisdom Panel geschickt. Die Sammlung dieser DNA-Proben dauerte etwas länger als erwartet, dies führte dazu, dass die Ergebnisse der zweiten Ende März 2021 an die Eigentümer gesendet wurden.

Was kann ich mit den Ergebnissen tun?

Von Wisdom erhält jeder Besitzer eine E-Mail, dass der DNA-Testbericht des Hundes auf verfügbar ist, das erstellt werden musste, um die Swabs zu registrieren. Dieser die DNA des Hundes auf verschiedene genetische Abweichungen untersucht wurde.

Wir nachdrücklich darauf hinweisen, dass die Abweichungen, mit Ausnahme von VWD, innerhalb der Rasse vorkommen. Die wichtigsten Daten, die durch die DNA-Analyse werden, ist die Bestimmung der genetischen Vielfalt des Hundes. Diese Daten sind für Fit2Breed für die Bestimmung der genetischen Variation/Vielfalt.

Was mache ich mit den Ergebnissen?

Nach dem Erhalt der E-Mail, die Sie vom Wisdom Panel erhalten haben, müssen Sie keine weiteren Maßnahmen ergreifen, indem Sie beispielsweise den DNA-Testbericht zur Aufnahme in die App Fit2Breed an den VHNK weiterleiten. Die Testergebnisse stehen in dieser App automatisch zur Verarbeitung zur Verfügung und liefern so den notwendigen Input zur Bestimmung der genetischen Variation innerhalb der Rasse. Die erzielten Ergebnisse sind daher ein wichtiger Beitrag zur neuen App Fit2Breed, die uns hoffentlich sehr kurzfristig helfen wird, auf eine verantwortungsvolle Weise gesunde und soziale Kooikerhondjes zu züchten.

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Kooikerhondje: the crossbreeding project in Finland

Contribution by the Finnish Kooikerhondje club “Suomen Kooikerhondje ry”

Why?

The main reason for starting this crossbreeding project is kooikerhondjes’ health problems: Polymyositis, other autoimmune diseases, different kinds of renal diseases, sterility in dogs (especially male infertility). Changing kooikers’ temperament is not our goal but we are looking for breeds that have traits which kooikers already have or which could result in a positive outcome sociability, boldness, curiosity, no sensitivity to sounds).

How?

The breeds and individuals used in these crossbreedings are first approved by The Finnish Kooikerhondje association’s breeding committee and then approved by The Finnish Kennel Club. The Finnish Kennel Club that makes the final decision on which breeds and individuals are used.

All individuals despite their breed must be health checked according to kooikerhondjes’ Finnish breeding regulations (eyes, patella, hips), kooikers must in addition be tested for vWd and ENM. Also their behaviour and temperament are evaluated (dog shows, mental tests, or hunting results… etc). Kooikerhondjes used in the crossbreeding project must have received at least VG (very good) in a dog show at the age of 15 months or older. All individuals used in the project must be at least 3 years old, and have had at least one litter earlier.

Presenting a breed includes giving information about their behaviour, temperament, health (and health problems) as well as conformation. A short summary of the breed’s history can be included. Breeds used in the crossbreeding project should resemble kooikerhondje by their temperament and overall appearance (e.g. other spaniels) or have no strong traits (e.g. Companion and Toy Dogs). Also other breeds from other FCI groups can be put under consideration.

The first generation of crossbred puppies (F1) are thoroughly evaluated based on health, temperament and conformation. As many dogs as possible from the first generation (F1) will be bred, and only dogs that fail to meet health and temperament requirements will be excluded from the breeding program at this point. The F1-dogs are registered to EJ-register (EJ = not for breeding) and if they meet the health and personality criteria set in the program will they be transferred to ER-register (ER = special register, can be used for breeding). We will use kooikerhondjes’ Club Register, the Finnish Breeding Database (KoiraNet) and fit2breed as tools to benefit kooikerhondje as a breed with these crossbreedings.

When? For how long?

The crossbreeding project is an on-going project. We would like to begin with 3-5 outcross litters with different breeds within the first five years (2021 – 2026).
After these first crossbred litters and the first F4-generation, more outcross litters will be made e.g. every 5 years as a way to increase the genetic diversity. This project is an addition to the other tools (exports, imports, foreign male matings, using different individuals to breeding) we use to help the gene pool become larger.

Approvals (timeline)

• In March 2019 the Finnish Kooikerhondje association had a vote regarding the crossbreeding project: it was approved.
• In June 2020 the Finnish Spaniel Club gave their approval to crossbreeding
• In September 2020 VHNK (Vereniging Het Nederlandse Kooikerhondje) gave their statement
• In January 2021 the Finnish Kennel Club approved kooikerhondjes’ crossbreeding project
• The crossbreeding program still needs to be elaborated and specified but the Finnish Kennel Club gave us permission to do one(1) crossbred litter without a finished program.

Note from the VHNK (February 2021)

From the Finnish Kooikerhondje club “Suomen Kooikerhondje ry” we got the news that in January 2021 the Finnish Kennel Club has approved the request for outcross.

During the authorization procedure, the application was also submitted to the VHNK. The board discussed this and pointed them to a number of key issues. According to the VHNK, an outcross is at this moment not the most desirable way to address the inbreeding problem. The VHNK’s plan is to achieve greater genetic diversity through a breeding support program. In Finland, breeders have health problems that can – but do not have to – be caused by inbreeding. We do not experience the same problems in the Netherlands. The outcross remains an independent decision of the Finnish club. The association has drawn up a well thought-out plan and ensures a good implementation.

Now we get the news that as part of the outcross project a female is mated with two different working-cocker males. The whole project will be carefully documented and monitored. We trust that the cooperation with the Finnish Club will continue to be good and that the whole Kooikerworld can learn from the experience.

Kerstin Ueckert
VHNK’s Chairman of the Board

Kooikerhondje: das Outcross Projekt in Finnland

Warum?

Der Hauptgrund für den Start dieses Kreuzungsprojekts sind gesundheitliche Probleme beim Kooikerhondje: Polymyositis, andere Autoimmunerkrankungen, verschiedene Arten von Nierenerkrankungen, Sterilität bei Hunden (vor allem männliche Unfruchtbarkeit). Es ist nicht unser Ziel, das Temperament der Kooiker zu ändern, aber wir suchen nach Rassen, die Eigenschaften haben, die Kooiker bereits haben oder die zu einem positiven Ergebnis führen könnten (Geselligkeit, Tapferkeit, Neugier, keine Geräuschempfindlichkeit).

Wie?

Die Rassen und Individuen, die in diesen Outcross verwendet werden, werden zuerst vom Zuchtausschuss des finnischen Kooikerhondje-Verbandes und dann vom Finnischen Kennel Club zugelassen. Dem finnischen Kennel Club obliegt die endgültige Entscheidung darüber, welche Rassen und Individuen verwendet werden.

Alle Individuen, ungeachtet ihrer Rasse müssen nach den finnischen Zuchtvorschriften für Kooikerhondjes (Augen, Patella, Hüften) gesundheitlich geprüft werden, Kooiker müssen zusätzlich auf vWd und ENM getestet werden. Auch ihr Verhalten und Temperament werden bewertet (Hundeshows, mentale Tests oder Jagdergebnisse… usw.). Kooikerhondjes, die im Outcrossprojekt verwendet werden, müssen mindestens VG (sehr gut) in einer Hundeausstellung im Alter von 15 Monaten oder älter erhalten haben. Alle individuellen Hunde, die im Projekt verwendet werden, müssen mindestens 3 Jahre alt sein und hatten schon mindestens einen Wurf.

Die Vorstellung einer Rasse umfasst Informationen über ihr Verhalten, Temperament, Gesundheit (und gesundheitliche Probleme) sowie Exterieur. Eine kurze Zusammenfassung der Geschichte der Rasse kann aufgenommen werden. Rassen, die im Outcrossprojekt verwendet werden, sollten im Temperament und Gesamtbild dem Kooikerhondje ähneln (z. B. andere Spaniel) oder keine ausgeprägten Arbeitseigenschaften haben (z. B. Begleithund- und Toy-rassen). Auch andere Rassen aus anderen FCI-Gruppen können in Betracht gezogen werden.

Die erste Generation von outcross Welpen (F1) wird gründlich auf Gesundheit, Temperament und Exterieur getestet. So viele Hunde wie möglich aus der ersten Generation (F1) werden in die Zucht genommen, und nur Hunde, die Gesundheits- und Temperamentanforderungen nicht erfüllen, werden an dieser Stelle vom Zuchtprogramm ausgeschlossen. Die F1-Hunde sind im EJ-Register eingetragen (EJ = nicht für die Zucht) und wenn sie die im Programm festgelegten Kriterien für Gesundheit und Temperament erfüllen, werden sie in das ER-Register überführt (ER = Sonderregister, kann für die Zucht verwendet werden). Wir werden das Kooikerhondje Club Register, die finnische Zuchtdatenbank (KoiraNet) und fit2breed als Werkzeuge verwenden, um der Rasse Kooikerhondje mit diesem Outcross Projekt Nutzen zuzuführen.

Wann? Wie lange?

Das Outcross Projekt ist ein laufendes Projekt. Unser Ziel sind 3-5 Outcross Würfen mit verschiedenen Rassen innerhalb der ersten fünf Jahre (2021 – 2026).
Nach diesen ersten Würfen und der ersten F4-Generation sollen etwa alle 5 Jahre mehr Outcross-Würfe vorgenommen werden, um die genetische Vielfalt zu erhöhen. Dieses Projekt ist zu sehen als eine Ergänzung zu den anderen Methoden (Exporte, Importe, Gebrauch von ausländischen Rüden, Einsatz verschiedener Individuen zur Zucht) die wir verwenden, um den Genpool zu vergrößern.

Genehmigungen

• Im März 2019 hatte der finnische Kooikerhondje Verein eine Abstimmung über das Outcross Projekt: es wurde genehmigt.
• Im Juni 2020 gab der finnische Spaniel Club seine Zustimmung zum Outcross Projekt
• Im September 2020 gab VHNK (Vereniging Het Nederlandse Kooikerhondje) seine Erklärung ab
• Im Januar 2021 genehmigte der finnische Kennel Club das Outcross Projekt von Kooikerhondjes
• Das Outcross Programm muss noch weiter ausgearbeitet und präzisiert werden, aber der finnische Kennel Club hat uns die Erlaubnis erteilt, einen (1) Wurf zu machen ohne abgeschlossenes Programm.

Benachrichtigung

Vom finnischen Kooikerhondje Club “Suomen Kooikerhondje ry” erhalten wir die Nachricht, dass der finnische Kennel Club dem Antrag auf Outcross zugestimmt hat, welche der Kooikerhondje Club vor einiger Zeit gestellt hat.

Im Rahmen des Genehmigungsverfahrens wurde der Antrag auch beim VHNK eingereicht. Der Vorstand hat sich mit der Zuchtkommission beraten und auf eine Reihe von Kernfragen hingewiesen. Nach Meinung des VHNK stellt ein Outcross derzeit nicht den besten Weg dar, um das Inzuchtproblem anzugehen. Der Plan der VHNK ist es, mit Hilfe eines Zuchtbegleitungsprogramms zu einer größeren genetischen Vielfalt zu kommen. In Finnland haben Züchter gesundheitliche Probleme, die mit Inzucht zusammenhängen können – aber nicht müssen. Wir erfahren in den Niederlanden nicht die gleichen Probleme. Das Outcross bleibt eine unabhängige Entscheidung des finnischen Clubs. Der Verein hat einen durchdachten Plan erstellt und sorgt für eine gute Umsetzung.

Jetzt bekommen wir die Nachricht, dass im Rahmen des Outcross-Projekts eine Hündin mit zweiverschiedenen Working-Cocker Rüden gedeckt wurde. Das gesamte Projekt wird sorgfältig dokumentiert und protokolliert. Wir vertrauen darauf, dass die Zusammenarbeit mit dem finnischen Club weiterhin gut sein wird und dass die gesamte Kooikerwelt aus diesen Erfahrungen lernen kann.

Kerstin Ueckert
Vorsitzende VHNK

At the beginning of this year the VHNK offered a risk assessment for polymyositis. This was meant as a temporary solution until Fit2Breed becomes available. Unfortunately, it turned out that the way Prof. Leegwater assesses the risk does not meet the expectations of our breeders at home and abroad.

Breeders get a result for one coincidentally chosen breeding pair, even if several of the given breeding pairs are assessed as low risk. It is done so as not to allow any conclusions about carriers.

As a scientist, it is important to Prof. Leegwater that the assessment does not make it possible to conclude whether dogs are carrier or free of polymyositis. If that were possible, dogs would be unnecessarily excluded from breeding.

Why are no results released from Utrecht for the other dogs? The answer lies in the following writing that we published on the website in December:

Polymyositis research (Dr. Peter Leegwater, Drs. Yvet Opmeer & Dr. Paul Mandigers)

There is some good news. We have found the mutation that can be associated with polymyositis. All the dogs with polymyositis which are examined by use have the mutation. This mutation is can be found close to two important genes involved in the functioning of the immune system. It also turns out that Kooikerhondjes suffering from polymyositis have an abnormal function of these two genes. So the mutation has no doubt a meaning.

However, not all the Kooikerhondjes with this mutation become ill. Kooikerhondjes that are homozygous for this mutation (they therefore have the two different alleles) have an increased risk, but not all of them will get sick. We see this more often with immune-mediated diseases. Environmental factors or variations in the rest of the DNA can cause a dog to become ill or not. That is why we call this mutation a risk factor. Also heterozygous Kooikerhondjes (Kooikerhondjes with only one deviating allele) are also at risk. That risk is very small (probably less than 1 percent) but present. Because there are many Kooikerhondjes with this mutation, we see that about 1 in 3 leaders of polymyositis is heterozygous (carrier) for the hereditary risk factor.

Pedigree research showed that other factors must play a role. We noticed for example that in some litters several dogs got sick, which would not make sense if the mutation is only expressed in a small proportion of the Kooikerhondjes. However, if there is a variation in the DNA that makes a dog more at risk or less at risk, this explains what we see in some litters.

In order to investigate this factor the DNA of a group of heterozygous leaders was compared to a group of homozygous leaders which have remained healthy throughout their lives. This comparison led to signals on two chromosomes that have been further investigated.

The first signal led to a DNA variant that seemed promising, but it turned out that it had a high frequency in the entire population. It was a false positive result that was a coincidental. The second signal could not yet be traced back to a variant in a gene. This investigation will be continued.

We hope that this resolves any uncertainties regarding the received results.

If you still want to request a risk assessment, you can do so via: Application polymyositis risk assessment.